日本FBA海运的流程一般包括以下步骤：
1. 确认货物可运输性：与物流供应商确认货物是否可以运输，并了解出口国的认证要求，以避免货物被海关拘留。特别是对于易燃易爆品、军用品、医疗器械、仿品牌、成人用品和大于100瓦的电池等特殊货物，需特别注意。
2. 订舱和预报：与货代合作，预订舱位，并提前两到三天提交SO单进行预报。同时准备好报关所需的相关资料。
3. 装箱：选择可以提供免费上门提货服务的货代公司，确保货物的准确件数、重量、体积等信息。与货代公司预约提货时间，并准备好装箱单。
4. 报关：进行退税报关和支付报关。准备所需的报关文件，包括外贸合同、发票、装箱单、报关委托书、报关单草单以及特殊单据如出境货物通关单和出口许可证等。遵循清关流程并确保材料准备完整。
5. 选择海运方式：通常有海运+卡车和海运+快递两种方式可选。海运+卡车需要预约入库，时效较不稳定，但成本相对较低。海运+快递则直接将货物送到FBA，无需预约，速度较快。
6. 清关：选择具有良好清关能力的货代公司，确保货物顺利通过清关程序。货代公司应具备海外清关团队，避免违禁品或危险品的运输，以避免不必要的麻烦和风险。
以上是日本FBA海运的一般流程，具体的操作可能会因物流供应商和货代公司的不同而有所差异。在选择物流服务提供商时，建议考虑其经验和信誉，并与其充分沟通以确保顺利运输和清关。
